做第三代试管婴儿可以降低多囊肾遗传几率，多囊肾是遗传性疾病，属于常染色体显性遗传，父母有一方患病子女有50%获得囊肿基因而发病，如父母均患此病子女发病率增加到75%。如果患有多囊肾的夫妻双方想要一个健康的宝宝，是可以选择三代试管的，目前第三代试管婴儿的PGS/PGD基因筛查通过率约为50%，当然由于每个人的身体状况、卵子和精子质量不同，因此成功的几率也不一样。
通过三代试管婴儿筛查技术可以避免多囊肾遗传，多囊肾一般都是16号、4号染色体的基因缺失导致的，而三代试管可以对染色体的数量及结构进行筛查，选出正常的胚胎进行移植，从而降低胎儿遗传多囊肾的几率。
多囊肾是一种影响肾脏和其他器官的疾病，会伴随并发症，如高血压、背部或两侧疼痛、血尿、反复尿路感染、肾结石和心脏瓣膜异常。此外多囊肾患者出现动脉瘤的风险还会增加，若动脉瘤破裂可能会危及生命。
多囊肾尚无特异治疗方法，因此早发现早干预，对于降低多囊肾的发生非常重要，目前患者可以通过三代试管婴儿技术，在胚胎制备过程时就能够及时剔除致病基因。
三代试管技术适用于夫妻中至少一人患有单基因遗传病，其在传统试管婴儿基础上加入了单基因遗传病筛查，也就是在胚胎移植前通过基因检测，筛选出优质胚胎，确保婴儿不再患有基因遗传病(包括多囊肾和其他基因遗传疾病)，从而提升试管成功率。
目前，多囊肾做第三代试管成功率还是比较高的，可以达到50%以上，但由于各种因素，该技术的成功率是因人而异的，而影响多囊肾三代试管成功率的因素主要有以下几个方面：
1、胚胎质量
胚胎质量是影响多囊肾做第三代试管成功率的重要因素，优质的胚胎会增加妊娠成功率，当然植入更多的胚胎更容易成功，但也增加了多胎的风险。
2、子宫内膜情况
如果多囊肾患者在做三代试管前有子宫内膜的损伤或炎症性病变，以及子宫腺肌症、子宫内膜息肉等疾病，均会导致着床难度增加，胚胎移植成功率下降。
3、内分泌因素
对于机体内分泌紊乱的多囊肾患者，即使做的是第三代试管，也可导致胚胎着床概率下降，且着床后内分泌紊乱也可导致胚胎停止发育、流产等。
